La colección de microorganismos de la Universidad de Nariño se creó como una necesidad del departamento de Biología de mantener, preservar y suministrar diferentes clases de especímenes derivados principalmente de trabajos de investigación y algunos microorganismos control (ATCC). El servicio que presta esta colección es sin animo de lucro y la finalidad esta enfocada en apoyar e incentivar la investigación en el departamento de Nariño a nivel de los centros de educación superior y entidades externas que lo requieran.

La colección se implementó para garantizar la conservación y viabilidad de los ejemplares durante periodos prolongados de tiempo evitando la pérdida de especímenes y garantizando su disponibilidad para futuras investigaciones. De igual manera, consolida e integra la información y los resultados relevantes a que ellos dieran lugar en las investigaciones.

Esta dependencia de la Universidad de Nariño creada recientemente cuenta con 72 ejemplares, clasificados taxonómicamente mediante pruebas bioquímicas de acuerdo con el manual de Bergey´s y técnicas moleculares. La finalidad de la colección es incrementar el número de especímenes y posicionarse como el principal depósito de especímenes en el suroccidente colombiano.